从技术的层面讲,膜结构不一定需要清洗.对于大多数膜材而言,清洗不能延长工作寿命,反而不恰当的清洗还会缩短其寿命.但出于美观的层面讲,膜结构定期清洗,可保持膜结构的美观,清洗时应采用专用清洗剂.
在设计和膜材选择中影响污垢堆积的因素有：
1.当地的降水量和频率.
2.空气污染情况.
3.与落叶树木和粘性花粉树木间的距离.

4.鸽子和海鸥等鸟类的排泄物.
5.屋面的倾斜程度（尽量避免较小的坡度,因为降雨不能完全排走,剩余水分的蒸发后会有污渍残留）.
6.涂层不沾灰尘的惰性.
膜结构清洗主要包括以下注意点：
(1) 大颗粒积灰应该用清水冲洗.
(2) 使用加工商指定的清洗剂并配套使用相应的软刷、海绵以及清洗设备清洗膜面,并用清水冲洗以便在膜面干燥前将灰尘和清洗剂冲走.

(3) 让清洗剂作用几分钟,但是要避免清洗区域被风干.
(4) 对于顽固污渍可能需要高浓度清洗剂刷洗,但要避免刮掉膜材的面层.
(5) 用清水冲洗清洗过的膜面直至没有清洗剂残留在膜面上为止.
使用清洗机很有可能会损坏涂层甚至冲漏膜材.为避免其发生,清洁机应配上安全防护装置以使喷水嘴不致距膜面太近.一个简单且便于判别的准则是能使皮肤感觉疼痛的物体都可能对膜材造成损失。